LSHTM_analysis/scripts/ml/running_scripts.txt

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Text

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# Ml iterator
# all genes : embb, gid, katg, pnca, rpob
# all split_types: 70_30, 80_20, sl, [rt, none_bts and none[with different cv thresholds]
# all data_types: actual, complete
# NOTE: rt, none_bts and none ONLY workd for complete
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time ./ml_iterator.py 2>&1 | tee genes_ml-$(date --iso).log
# FOR NONE-complete data
time ./ml_iterator_CVs.py 2>&1 | tee genes_ml_CVs-$(date --iso).log
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###################### Feature Selection ##########################
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